$.MTAppApplyTinyMCE() を適用したときの入力欄のサイズは、適用する前のテキストエリアの大きさに依存します。

したがって、 $.MTAppApplyTinyMCE() を適用したときの入力欄を大きくするには、 user.css で元のテキストエリアを大きくしておきます。

下記は、概要欄を $.MTAppApplyTinyMCE() でリッチテキストにして、そのエディタの高さを 500px くらいにする場合の例です。

user.css

#excerpt {
  height: 500px;
}

user.js

$.MTAppApplyTinyMCE({
    target: ['excerpt'],
    sortable: true
});